1969年，EV71首次从加利福尼亚患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中分离出来。1974年，这类病毒被首次公开报道，此后EV71在世界范围内引起十多次爆发与流行，全世界很多国家和地区，如澳大利亚 、瑞典 、日本、保加利亚、匈牙利 、马来西亚、新加坡、中国香港、中国台湾 、中国大陆等，先后报道了EV71的感染和流行情况。
其中有3次大的流行：1975年保加利亚大流行，共有705名患儿受到感染，其中149例发生急性弛缓性瘫痪，44例死亡；1997年马来西亚大流行，共有2628例发病，39例急性脊髓灰质炎样麻痹或无菌性脑膜炎，30多例患儿死亡，其平均年龄1.5岁；1998年中国台湾地区EV71大爆发，共发生129106例手足口病和红斑疹，其中405例为严重的中枢神经系统感染，78例死亡，死亡原因主要为由中枢神经系统感染而导致的肺水肿和出血(83%)，91%的死亡患儿小于5岁。台湾在2000年又有一次EV71大爆发，这次有80677人染病，41人死亡。
自1997年来，EV71病毒的流行在亚太地区呈上升趋势。而从1999年开始，中国广东、福建、上海、重庆等地区报告局部流行EV71感染，发现EV71是中国南方地区手足口病的主要病原之一，中国内地的EV71毒株在种系进化上有较高的同源性，与台湾地区大部分分离株亦有90%～91%的核苷酸同源性，但大陆EV71引起的手足口病和神经系统症状较轻，有别于1998年台湾地区的EV71大爆发。
EV71的症状传播与治疗
人类肠道病毒EV71是小RNA病毒科，肠道病毒属成员。不同的亚型感染后临床症状不完全相同，通常主要引起患者手足口病(HFMD)和无菌性脑膜炎、脑干脑炎和脊髓灰质炎样的麻痹等多种与神经系统相关的疾病，致残及病死率较高。
目前，人类是EV71病毒唯一已知的自然宿主，病毒主要通过人群间的密切接触传播，病毒经过被感染者的口鼻分泌物、粪便和飞沫等传播。中国大陆EV71的分子流行病学资料还不完整, 采样标本主要来源于手足口病患者。
统计资料表明，感染EV71病毒发病后，重症患者病死率可达10%～25%。由于迄今没有特效的抗病毒药，辅助治疗手段尤其重要，其治疗效果就与发病地方的整体医疗卫生条件紧密相关。
EV71病毒的实验室诊断
肠道病毒的常规诊断为病毒分离培养和血清学方法，繁杂费时，无法满足病毒流行期间同时处理大量样本的需要。逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)技术克服了以上缺点，已成为肠道病毒感染快速诊断的重要手段。